Если датчик токовый, то проблема в кратковременной помехи (наводка) в линии, я столкнулся с такой же, только использовал датчики давления (токовые). Долго искал проблему. В результате выявил что при пуске частотника (Danfoss VLT HVAC Drive FC 102 37 кВт 131F5451) давление практически сразу падало в 0, что соответствует вашему графику (все кабеля с экраном, все заземлено и т.д. (по феншую)).
Решение заменил токовые датчики на датчики с выходом 0-10В. и проблема ушла. (другие варианты не помогли)
Попробуйте Временно отключить токовый канал датчика канала температуры и в место него установить обычный PT1000 (или какой нибудь другой), не забыв поправить проект.
Или ищите что может вызывать помеху.
Резкое падение Т канала без изменения вторичных данных скорее всего ни как не связана с работой алгоритма оборудования.