Контроллер у вас Матрикс? Что из периферии подключено?
Выставленные 10 мсек это не жёсткий приказ работать с этим циклом, а скорее ваше пожелание. А контроллер его выполняет как может - его быстродействие конечно.
Подробности:
https://dl.segnetics.com/WebHelp/SMLogix/base_tick.htm
Что касается 2 тыс блоков, то скорее всего дело не в них. Матриксу это семечки.